一家物流公司2011年9月收取运费总额20万元，但是在运输途中发生货物毁损1万元，损失由该公司承担。公司向江西省国税局12366纳税服务热线咨询，可否将货物毁损部分从收取的运费总额中扣除后，再缴纳营业税。